Навколишнє середовище складається з безлічі різних елементів. Дуже складні кореляції між цими елементами становлять довкілля-простір. Основними викликами для аналізу навколишнього середовища є різні елементи довкілля-простору, їх взаємозв'язок між собою, часові та геопросторові зміни у цих відносинах. ГІС пропонує можливість проводити аналіз з метою створення нової геопросторової інформації, використовуючи поточну екоінформацію та аналізуючи декілька шарів даних разом або окремо. Наприклад, модуль «Просторовий аналіз» у ГІС, який зокрема включає методи вимірювання, класифікації та накладання, може бути легко використаний.